夜晚时分，小智一行人也是来到了正辉灯塔的内部，见到了脱掉布偶装的正辉博士，今天的故事就由此展开。
解放出来的正辉博士也是向小智一行人做起了自我介绍，虽然小智知道自己的身份，但樱花和圣代不知道呀，所以正辉也是在此刻做出了选择。
“各位幸会，我就是神奇宝贝研究家——正辉。”脱掉布偶装的正辉说道。
“你好，我叫圣代。”神奇宝贝学院的老大——原“优等骄子”介绍道。
“你好，我是来自华蓝市的樱花。”黄色长发的樱花介绍道。
“正辉博士，好久不见。”小智也是走上前，对博士说道。
“小智，好久不见啦。上次见面还是在你小的时候呢。当时，你和大木博士一起发表的论文可是震惊了整个研究界，虽然在论文上你的名字比较小，但是我还是留意到了，还迫不及待的见了你一面，没想到这么久没见，你都长这么大了。”正辉博士也是侃侃而谈道。
“博士，其实也没有什么啦。就是偶然发现罢了。”小智挠挠头，说道。
“这也很了不起了。”正辉也是对小智赞不绝口道。
“什么！小智你竟然发表过论文！？”圣代十分惊讶地说道。而一旁的圣代则是静静地看着，好像对此没有什么特别的感觉。毕竟小智展现出来的实力就和一般刚刚出道的神奇宝贝训练家相差甚远，在神奇宝贝研究方面有点成就也正常。
“是呀。就是前几年著名的伊布进化论。补充了伊布的进化形态。给我们人类在认识神奇宝贝的道路上又添上了浓浓一笔。真是太惊艳了。”作为神奇宝贝研究学家的正辉，自然知道每项的研究有多么不易，所以才会如此称扬小智。然而他显然不知道小智其实是在系统的默默影响下才研究出来的。有了系统，研究也自然而然的简单了起来。
“是那个论文啊。当时我还听我姐姐说过，没想到竟然是你研究出来的。”圣代恍然大悟道。但反观樱花，她似乎有些迷茫的样子，好似不知道这篇论文的问世一般。但其实她是真的不知道，因为她并不热衷于神奇宝贝对战，她比较偏爱水上芭蕾和通过书籍以及图片来观赏旅游圣地，这也因此导致了华蓝道馆在她当家的时间段里面，被称为是关都最差的道馆。
“博士，您谬赞了。我也并没有那么优秀的。”小智微微一笑，谦逊地说道。紧接着，小智又打开了自己的嘴巴，对博士说道：“对了，正辉博士。你的研究怎么样了？”
“有了些许的进展吧。但是进展的不是很顺利。”正辉叹了叹气说道。
“别气馁，博士。研究就是这样，要慢慢来。水到渠成的事情，着急不得。”小智也是开口安慰正辉道。
“是呀。研究的确就是如此呀。”正辉点了点头，道。
这时，一头雾水的圣代又发话了。
“小智，博士，你们聊的研究是什么呀？”
“是博士的研究啦。博士，劳烦您向她们细细地讲解了。我了解地不是很全面，怕解释不清楚。”小智对说道。
“不碍事的小智。那我就来详细介绍一下我的论文吧。”正辉也是微微一笑，接着开始了对自己研究的描述。
“在我的研究范围内，我认为每只神奇宝贝都是有‘心’的。它们有自己的行为，自己的思想，自己的心情，我现在的研究就是为了能够了解已经绝种的神奇宝贝们，到底是以怎样的心情活在这个星球上面的，所以我才进入布偶装里面，去了解它们。”
“进入布偶装就能了解神奇宝贝的心情吗？”刚刚一只保持安静的樱花也是在此时说出了自己的困惑之处。
“可以的。我想应该是可以的。因为这个星球已经形成了四十六亿年。有许多生物诞生在这里，一定也各自拥有很多的感情，活在这个星球上。”
“拥有着很多情感在这个星球上。”樱花嘴里重复着正辉博士说的话，似乎有些领悟。
接着，正辉博士说道：“目前为止，这个星球上，已知的神奇宝贝超过了一百五十多种。”
“一百五十多种？”一向不了解神奇宝贝的樱花听到这个数字也是震惊道。而圣代却一脸平静，显然是知道目前发现的神奇宝贝数目的。
“你们是神奇宝贝训练家，目标是舒服所有的神奇宝贝，就这样很好。而且进一步说，这也只是人类所知道的数量罢了，这个世界上还有许多不为人知的神奇宝贝。但是无数的神奇宝贝们，都有它们自己的生存方式。神奇宝贝活在这颗星球上是有意义的。思考这件事情，也等于思考我们人类为什么生存在这个星球上的意义。这个星球上所有的生物都有其存在的意义。你们再继续去获得更多的新的神奇宝贝吧。那对神奇宝贝神奇宝贝研究是非常重要的。而现在我正在等待着一只独一无二的神奇宝贝。”
“独一无二的神奇宝贝？”这次轮到小智震惊了，毕竟他是个神奇宝贝狂热者，对新的神奇宝贝自然也是充满了浓浓
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